Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox4fQ2MDF8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox4fQ2MDF8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms