Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nlrp1aQ2LKU9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms