Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc39dQ0VF76 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Ttc39dQ0VF76 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ttc39dQ0VF76 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ttc39dQ0VF76 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Ttc39dQ0VF76 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Ttc39dQ0VF76 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttc39dQ0VF76 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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