Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd12Q0VE29 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd12Q0VE29 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms