Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrioQ0KL02 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms