Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q08AU9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q08AU9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q08AU9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q08AU9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q08AU9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q08AU9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q08AU9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q08AU9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q08AU9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q08AU9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q08AU9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q08AU9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q08AU9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q08AU9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q08AU9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q08AU9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q08AU9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q08AU9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q08AU9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms