Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssrp1Q08943 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssrp1Q08943 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms