Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CbfbQ08024 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CbfbQ08024 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CbfbQ08024 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CbfbQ08024 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CbfbQ08024 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CbfbQ08024 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CbfbQ08024 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CbfbQ08024 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms