Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms