Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms