Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SryQ05738 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SryQ05738 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SryQ05738 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SryQ05738 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SryQ05738 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SryQ05738 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SryQ05738 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SryQ05738 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SryQ05738 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SryQ05738 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SryQ05738 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SryQ05738 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SryQ05738 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SryQ05738 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SryQ05738 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SryQ05738 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SryQ05738 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SryQ05738 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SryQ05738 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SryQ05738 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SryQ05738 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SryQ05738 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SryQ05738 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SryQ05738 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SryQ05738 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SryQ05738 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SryQ05738 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SryQ05738 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SryQ05738 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SryQ05738 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SryQ05738 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SryQ05738 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SryQ05738 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SryQ05738 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SryQ05738 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SryQ05738 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SryQ05738 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SryQ05738 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SryQ05738 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SryQ05738 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SryQ05738 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SryQ05738 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SryQ05738 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SryQ05738 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SryQ05738 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SryQ05738 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SryQ05738 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms