Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcad1Q04692 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smarcad1Q04692 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcad1Q04692 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms