Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnb1Q03717 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnb1Q03717 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms