Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crisp3Q03402 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms