Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb5Q02739 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms