Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp1Q01514 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp1Q01514 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms