Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LystP97412 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LystP97412 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LystP97412 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LystP97412 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LystP97412 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LystP97412 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LystP97412 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LystP97412 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LystP97412 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LystP97412 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LystP97412 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LystP97412 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LystP97412 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LystP97412 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LystP97412 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LystP97412 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LystP97412 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LystP97412 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LystP97412 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LystP97412 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LystP97412 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LystP97412 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LystP97412 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LystP97412 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LystP97412 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LystP97412 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LystP97412 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LystP97412 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LystP97412 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LystP97412 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LystP97412 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LystP97412 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LystP97412 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LystP97412 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LystP97412 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LystP97412 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LystP97412 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LystP97412 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms