Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhodP97348 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhodP97348 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhodP97348 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhodP97348 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhodP97348 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhodP97348 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhodP97348 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhodP97348 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhodP97348 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhodP97348 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhodP97348 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhodP97348 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhodP97348 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhodP97348 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhodP97348 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhodP97348 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RhodP97348 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RhodP97348 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhodP97348 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhodP97348 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhodP97348 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhodP97348 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhodP97348 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhodP97348 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhodP97348 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhodP97348 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhodP97348 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhodP97348 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhodP97348 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhodP97348 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RhodP97348 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms