Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1bP70700 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms