Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim4P70271 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.6 ms