Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtgdrP70263 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms