Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chl1P70232 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chl1P70232 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chl1P70232 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chl1P70232 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chl1P70232 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chl1P70232 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chl1P70232 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chl1P70232 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms