Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtnP63089 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtnP63089 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtnP63089 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtnP63089 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtnP63089 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtnP63089 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtnP63089 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtnP63089 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtnP63089 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtnP63089 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtnP63089 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtnP63089 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtnP63089 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtnP63089 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtnP63089 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtnP63089 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtnP63089 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtnP63089 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtnP63089 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtnP63089 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtnP63089 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtnP63089 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtnP63089 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtnP63089 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtnP63089 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtnP63089 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtnP63089 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtnP63089 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtnP63089 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtnP63089 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtnP63089 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtnP63089 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtnP63089 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtnP63089 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtnP63089 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtnP63089 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtnP63089 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtnP63089 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms