Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SnrpfP62307 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpfP62307 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpfP62307 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpfP62307 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms