Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms