Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps5P59438 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps5P59438 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps5P59438 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps5P59438 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps5P59438 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps5P59438 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hps5P59438 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms