Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup43P59235 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup43P59235 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms