Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhbdl3P58873 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl3P58873 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms