Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd4P58467 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd4P58467 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd4P58467 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd4P58467 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd4P58467 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd4P58467 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Setd4P58467 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms