Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd3P55096 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd3P55096 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms