Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2e3P52483 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms