Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms