Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XpcP51612 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XpcP51612 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XpcP51612 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XpcP51612 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XpcP51612 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XpcP51612 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XpcP51612 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XpcP51612 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XpcP51612 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XpcP51612 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
XpcP51612 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XpcP51612 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XpcP51612 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XpcP51612 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XpcP51612 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XpcP51612 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XpcP51612 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XpcP51612 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XpcP51612 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XpcP51612 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XpcP51612 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XpcP51612 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XpcP51612 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XpcP51612 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XpcP51612 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XpcP51612 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XpcP51612 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XpcP51612 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XpcP51612 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XpcP51612 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XpcP51612 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XpcP51612 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XpcP51612 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XpcP51612 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XpcP51612 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XpcP51612 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XpcP51612 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XpcP51612 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XpcP51612 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XpcP51612 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XpcP51612 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XpcP51612 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XpcP51612 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XpcP51612 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XpcP51612 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XpcP51612 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XpcP51612 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XpcP51612 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XpcP51612 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XpcP51612 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XpcP51612 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XpcP51612 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XpcP51612 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XpcP51612 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XpcP51612 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XpcP51612 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XpcP51612 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
XpcP51612 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XpcP51612 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XpcP51612 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XpcP51612 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XpcP51612 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XpcP51612 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms