Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf10P50592 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf10P50592 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfsf10P50592 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfsf10P50592 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf10P50592 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf10P50592 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf10P50592 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms