Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd7P50283 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms