Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc13P50207 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms