Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb42P49222 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb42P49222 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb42P49222 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb42P49222 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epb42P49222 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epb42P49222 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epb42P49222 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms