Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca1P48754 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca1P48754 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca1P48754 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca1P48754 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca1P48754 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brca1P48754 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brca1P48754 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brca1P48754 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brca1P48754 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brca1P48754 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brca1P48754 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brca1P48754 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca1P48754 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms