Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zic1P46684 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zic1P46684 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zic1P46684 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zic1P46684 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Zic1P46684 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic1P46684 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms