Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgavP43406 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms