Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlx1P43345 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlx1P43345 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlx1P43345 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlx1P43345 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlx1P43345 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlx1P43345 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlx1P43345 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlx1P43345 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlx1P43345 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlx1P43345 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlx1P43345 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms