Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ThpoP40226 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ThpoP40226 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms