Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik2P39087 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik2P39087 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik2P39087 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms