Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptger1P35375 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptger1P35375 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms