Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms