Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcam1P29533 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms