Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RxraP28700 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RxraP28700 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RxraP28700 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RxraP28700 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RxraP28700 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RxraP28700 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RxraP28700 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RxraP28700 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RxraP28700 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RxraP28700 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RxraP28700 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RxraP28700 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RxraP28700 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RxraP28700 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RxraP28700 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RxraP28700 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RxraP28700 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RxraP28700 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RxraP28700 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RxraP28700 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RxraP28700 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RxraP28700 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RxraP28700 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RxraP28700 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RxraP28700 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RxraP28700 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RxraP28700 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RxraP28700 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RxraP28700 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RxraP28700 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RxraP28700 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RxraP28700 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RxraP28700 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RxraP28700 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RxraP28700 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RxraP28700 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RxraP28700 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RxraP28700 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RxraP28700 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RxraP28700 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RxraP28700 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RxraP28700 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RxraP28700 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RxraP28700 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RxraP28700 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RxraP28700 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RxraP28700 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RxraP28700 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RxraP28700 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RxraP28700 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RxraP28700 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RxraP28700 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RxraP28700 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RxraP28700 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RxraP28700 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RxraP28700 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RxraP28700 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RxraP28700 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RxraP28700 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RxraP28700 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RxraP28700 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RxraP28700 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RxraP28700 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RxraP28700 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RxraP28700 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RxraP28700 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RxraP28700 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms