Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vav1P27870 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vav1P27870 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vav1P27870 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vav1P27870 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vav1P27870 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav1P27870 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav1P27870 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav1P27870 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav1P27870 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms