Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af2P26369 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af2P26369 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af2P26369 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af2P26369 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af2P26369 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af2P26369 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af2P26369 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af2P26369 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms