Protein–RNA interactions for Protein: P23798

Pcgf2, Polycomb group RING finger protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf2P23798 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcgf2P23798 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf2P23798 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcgf2P23798 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcgf2P23798 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcgf2P23798 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcgf2P23798 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcgf2P23798 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcgf2P23798 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms